Protein–RNA interactions for Protein: A2A870

Fbf1, Fas-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbf1A2A870 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbf1A2A870 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbf1A2A870 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms