Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms