Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Nek3Q9R0A5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Nek3Q9R0A5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Nek3Q9R0A5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
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Nek3Q9R0A5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Nek3Q9R0A5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Nek3Q9R0A5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Nek3Q9R0A5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Nek3Q9R0A5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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