Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ChmQ9QXG2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms