Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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