Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx6Q9JKK1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx6Q9JKK1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms