Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ap3m1Q9JKC8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap3m1Q9JKC8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms