Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms