Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms