Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms