Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms