Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms