Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms