Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms