Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms