Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2A5

Creb3l4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l4Q9D2A5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Creb3l4Q9D2A5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Creb3l4Q9D2A5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Creb3l4Q9D2A5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Creb3l4Q9D2A5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Creb3l4Q9D2A5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Creb3l4Q9D2A5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l4Q9D2A5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l4Q9D2A5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l4Q9D2A5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l4Q9D2A5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l4Q9D2A5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l4Q9D2A5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l4Q9D2A5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l4Q9D2A5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l4Q9D2A5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l4Q9D2A5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l4Q9D2A5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l4Q9D2A5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l4Q9D2A5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Creb3l4Q9D2A5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms