Protein–RNA interactions for Protein: Q9D132

Upk1a, Uroplakin-1a, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1aQ9D132 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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