Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Shisa9Q9CZN4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Shisa9Q9CZN4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Shisa9Q9CZN4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Shisa9Q9CZN4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Shisa9Q9CZN4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Shisa9Q9CZN4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Shisa9Q9CZN4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Shisa9Q9CZN4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Shisa9Q9CZN4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Shisa9Q9CZN4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Shisa9Q9CZN4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Shisa9Q9CZN4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Shisa9Q9CZN4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Shisa9Q9CZN4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Shisa9Q9CZN4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Shisa9Q9CZN4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Shisa9Q9CZN4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms