Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thumpd2Q9CZB3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms