Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed5Q9CXE7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms