Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms