Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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