Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms