Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms