Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Apol9aQ8VDU3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms