Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep57l1Q8VDS7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms