Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1mtQ8R4U6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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