Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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