Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Abcf3Q8K268 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf3Q8K268 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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