Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pkn3Q8K045 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkn3Q8K045 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pkn3Q8K045 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkn3Q8K045 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pkn3Q8K045 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkn3Q8K045 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pkn3Q8K045 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pkn3Q8K045 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkn3Q8K045 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pkn3Q8K045 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pkn3Q8K045 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkn3Q8K045 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pkn3Q8K045 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkn3Q8K045 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkn3Q8K045 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkn3Q8K045 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkn3Q8K045 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pkn3Q8K045 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pkn3Q8K045 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pkn3Q8K045 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pkn3Q8K045 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn3Q8K045 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Pkn3Q8K045 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Pkn3Q8K045 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pkn3Q8K045 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms