Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms