Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms