Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE50

Snx30, Sorting nexin-30, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx30Q8CE50 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx30Q8CE50 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Snx30Q8CE50 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx30Q8CE50 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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