Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc87Q8CDL9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms