Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrebrfQ8CDG5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms