Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C1R3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C1R3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C1R3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C1R3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C1R3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C1R3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8C1R3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms