Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms