Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms