Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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