Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc172Q810N9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms