Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdc42bpbQ7TT50 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms