Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNM2

Trim46, Tripartite motif-containing protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim46Q7TNM2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim46Q7TNM2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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