Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Dsg4Q7TMD7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Dsg4Q7TMD7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Dsg4Q7TMD7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dsg4Q7TMD7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dsg4Q7TMD7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Dsg4Q7TMD7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dsg4Q7TMD7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dsg4Q7TMD7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms