Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Trappc6aQ78XR0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6aQ78XR0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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