Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms