Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms