Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms