Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms