Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim24Q64127 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim24Q64127 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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