Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr2kQ63871 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms